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Il Centro Regionale di Castanicoltura del Piemonte, sorto nel 2003, è stato istituito formalmente con la Legge Regionale n° 4 del 10 febbraio 2009.

Presso il Centro il personale del DISAFA dell'Università degli Studi di Torino conduce e promuove attività di ricerca, di base e applicata, per fornire risposte scientifiche e tecniche alle problematiche della castanicoltura, contribuendo a rilanciare il settore produttivo, a migliorarne la competitività e valorizzare il castagno come albero da frutto, da legno e componente caratterizzante degli ecosistemi montani e pedemontani.

Il Centro ospita un Castanetum (collezione di germoplasma) in cui sono raccolte diverse specie di castagno (C. sativa, C. crenata, C. pumila, C. mollissima, C. dentata) ed ibridi intraspecifici (C. sativa x C. crenata, C. crenata x C. mollissima). Numerose sono le ricerche condotte nei seguenti settori: arboricoltura e tecniche vivaistiche, entomologia, patologia, breeding e biotecnologie, selvicoltura e gestione delle produzioni legnose, tecnologie del legno, paesaggio.

Nel Castanetum è presente una capannina per la registrazione dei dati meteorologici. Il Centro è dotato inoltre di campi sperimentali, serre, tunnel, minitunnel con impianto fog, riscaldamento basale elettrico ed illuminazione LED, attrezzature agricole per le attività vivaistiche.

Attrezzatura acquisita anche con il contributo congiunto dell’Unione Europea, dello Stato Italiano e della Regione Piemonte nell’ambito del Programma di Sviluppo Rurale 2014-20.

Grazie alla molteplicità di competenze, il Centro fornisce i seguenti servizi:

• sportello per il supporto e l’assistenza tecnica alle imprese
• analisi fitopatologiche
• analisi entomologiche
• analisi chimiche e merceologiche
• panel analisi sensoriale e prodotti innovativi
• analisi genetiche
• supporto all’attività vivaistica
• recupero produttivo vecchi castagneti
• progettazione nuovi impianti e gestione forestale
• formazione e informazione.

È possibile accedere all'infrastruttura su prenotazione, accompagnati da personale autorizzato. Le tariffe e le modalità di accesso all’infrastruttura sono definite in funzione delle richieste specifiche.

• Laboratori di Biologia Molecolare
• Due apparati per microiniezione di embrioni equipaggiati con microscopi ad ottica Nomarski
• Elettroporatore
• Microscopi stereoscopici
• Allevamento SPF per topi di diversi ceppi da utilizzare come donatori e riceventi
• Facility SPF

Attrezzatura acquisita anche con il contributo di Regione Piemonte.

• Costruzione di plasmidi per la ricombinazione omologa in cellule ES
• Generazione di cellule ES mutanti tramite gene targeting, inclusa l’analisi genetica
• Differenziamento di cellule ES di tipo selvatico o mutanti in vitro tramite generazione di embryoid bodies o stimolazione del differenziamento di lineages specifici
• Microiniezione di cellule ES, generate in house oppure acquisite tramite i consorzi pubblici, al fine di generare topi chimerici
• Generazione di topi mutanti (KO, K/in) tramite il sistema CRISPR/Cas9 e la manipolazione diretta degli zigoti
• Screening dei cuccioli nati per individuare e caratterizzare gli alleli mutanti
• Servizio di generazione di linee cellulari o di cellule primarie mutanti tramite il sistema CRISPR/Cas9 allo scopo di sovra-esprimere una proteina, silenziare un gene, o eventualmente mutagenizzarlo (servizio fornito in aggiunta, se richiesto).

E’ possibile accedere al servizio previo contatto via email con la Prof.ssa Poli. Il progetto proposto verrà discusso durante una riunione preliminare, che servirà anche per disegnare la strategia sperimentale più adeguata.
Le tariffe vengono definite in funzione delle richieste specifiche.

CyAn™ ADP analyzer, Beckman Coulter:

• Due laser di eccitazione: 488 e 635 nm
• Ottica di messa a fuoco indipendente priva di allineamento
• Sette colori simultanei
• Due parametri di dispersione
• Tassi di analisi di 70.000 eventi al secondo.

Applicazioni

• Analisi di precisione di cellule, batteri e altre particelle di dimensioni simili
• Strumento ottimizzato per ciclo cellulare, cinetica, studio di proteine fluorescenti e immunofenotipizzazione multi-colore
• Analisi di eventi rari, come studi di MHC Dextramer
• Compensazione semplificata prima e durante l'acquisizione in tutti i parametri fluorescenti

Servizi

• Consulenza nel disegno sperimentale
• Formazione dei nuovi utenti
• Assistenza tecnica
• Consulenza per l'analisi quantitativa dei dati ottenuti

È possibile accedere all'infrastruttura su prenotazione, accompagnati da personale autorizzato.
Le tariffe sono definite in funzione delle richieste specifiche.

Caratteristiche essenziali (Ultra congelatore criogenico) MDF-C2156VAN:

• Ultra compressore a bassa temperatura
• Conservazione campioni biologici (colture di microrganismi) a basse temperature.
• Brevettato V.I.P., pannello di isolamento di vuoto ad alta densità
• Tre livelli di sicurezza mobile
• No CFC
• Maggiore affidabilità di conservazione a lungo termine
• Funzioni avanzate di controllo
• LED display digitale e immissione dei dati chiave piatta per una precisa impostazione di temperatura
• Ultra-bassa temperatura creata da un separatore d'olio ad alta efficienza
• Materiale isolante in poliuretano espanso speciale-in-place per la massima protezione
• Apparecchiature di avvertimento ad alta temperatura
• Spia di allarme di interruzione di corrente e buzzer
• Contatto di allarme remoto

Il congelatore è ideale per lo stoccaggio criogenico e lungo termine nei laboratori e non utilizza alcun dannoso CFC per ottenere una temperatura ultra bassa di -150ºC.

Attrezzatura acquisita anche con il contributo della Fondazione CRT.

Conservazione campioni biologici (colture di microrganismi e loro derivati) a basse temperature.

Si ricorda che la MUT offre anche servizi relativi all'isolamento, identificazione e caratterizzazione di microrganismi con particolare riferimento ai funghi.

Le modalità di accesso all’infrastruttura sono disponibili su www.mut.unito.it » Servizi.
Il tariffario è consultabile su www.mut.unito.it » Servizi » Tariffario.

• Fluorescenza (con tecnologia a quadruplo monocromatore) in modalità top e bottom
• Assorbanza con tecnologia a doppio monocromatore (range 230-1000 nm) o a filtri
• Alpha Technology
• Luminescenza
• Label-free Technology

Attrezzatura acquisita anche con il contributo della Compagnia di San Paolo.

Applicazioni

• Saggi enzimatici
• Saggi di binding-ligando recettore

Servizi

• Alpha Technology come alternativa a western blot e saggi Elisa tradizionali
• Consulenza nel disegno sperimentale
• Formazione dei nuovi utenti
• Assistenza tecnica
• Consulenza per l'applicazione di tecniche avanzate

È possibile accedere all'infrastruttura su prenotazione, accompagnati da personale autorizzato.
Le tariffe e le modalità di accesso all’infrastruttura sono consultabili su www.dstf.unito.it » Servizi e strutture » Dotazioni del Dipartimento – Open Access » En-Sight.

• Il liofilizzatore - LIO 10P Automatic Special Plant - 5Pascalconsente di liofilizzare in sterilità circa 100 campioni di ampolle (vials) contemporaneamente
• I liofilizzatori a piastre 5Pascal della serie LIO10P sono espressamente progettati per cicli produttivi brevi e riproducibili

Liofilizzazione di risorse biologiche (colture di microrganismi) e loro derivati in sterilità.

Si ricorda che la MUT offre anche servizi relativi all'isolamento, identificazione e caratterizzazione di microrganismi con particolare riferimento ai funghi.

Le modalità di accesso all’infrastruttura sono disponibili su www.mut.unito.it » Servizi.
Il tariffario è consultabile su www.mut.unito.it » Servizi » Tariffario.

Microflex-MALDI TOF-MS Bruker Daltonics:

• MALDI-TOF-MS (Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization)
• Lo strumento opera in Linear-, Reflector- e Psd-Mode
• Lo strumento contiene un laser CLASS IIIB con emissione a 337nmUV-light
• Il vuoto è generato da tre pompe totalmente integrate nel sistema capaci di raggiungere una pressione di vuoto pari a 2X10-6 mbar
• I Micro Scout Plates a disposizione sono tre, due MSP96, e uno Anchorchip.

Applicazioni

• Identificazione di proteine intere in Linear mode
• Identificazione di proteine digerite in Reflector mode e in PSD mode.

Servizi

• Consulenza nel disegno sperimentale
• Consulenza tecnica.

È possibile accedere all'infrastruttura su prenotazione, accompagnati da personale autorizzato.
Le tariffe sono definite in funzione delle richieste specifiche.

Strumentazioni

• Sequenziatore Illumina NextSeq 1000
• Sequenziatore Illumina NextSeq 500
• Sequenziatore MiSeq
• TapeStation 4150 Agilent
• Bioruptor Pico Diagenode
• Cluster TERA-X-CLS-013

Specifiche tecniche

• Sequenziatore Illumina NextSeq 1000 è dotato di un nuovo sistema ottico di super risoluzione che è ottimizzato per aumentare la luminosità dei cluster, ridurre il cross-talk dei canali e migliorare il rapporto segnale-rumore. Fornisce un output flessibile da 30 Gb fino a 120 Gb.
• Sequenziatore Illumina NextSeq 500 è un sequenziatore in grado di sequenziare da un minimo di 16 Gb fino ad un massimo di 120 Gb con “reads” di 75 o 150 paia di basi.
• MiSeq è un sequenziatore di minori dimensioni molto versatile. Con questo strumento si può sequenziare da un minimo di 500 Mb ad un massimo di 15 Gb con “reads” di 300 basi.

Il sequenziatore Illumina NextSeq 1000, la TapeStation 4150 Agilent, il Bioruptor Pico Diagenode e il server di calcolo e gestione dati Cluster TERA-X-CLS-013 sono stati acquisiti grazie a finanziamento Regione Piemonte - Bando INFRA-P.

I sequenziatori Illumina NextSeq 500 e MiSeq sono stati acquisiti con il contributo di Compagnia di San Paolo.

La piattaforma NGS offre un servizio di sequenziamento mediante Next Generation Sequencing (NGS).

Applicazioni

• Whole Genome Sequencing
• Whole Exome Sequencing
• Amplicon Sequencing
• Target Gene Sequencing
• Whole Transcriptome Sequencing
• Poly(A)-RNA Sequencing
• Small RNA Sequencing
• Ultra-Low Input RNA Sequencing
• Single Cell RNA Sequencing
• Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS)
• Ultra-Low Input WGBS
• Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
• Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
• ATAC-seq

Le attività sono svolte secondo le seguenti modalità: quantificazione materiale di partenza, controllo qualità materiale di partenza, generazione di libreria NGS, controllo qualità libreria NGS, sequenziamento massivo in parallelo su piattaforma Illumina, demultiplexing e controllo qualità sequenziamento.

Servizi

• Consulenza nel disegno sperimentale
• Consulenza sulla modalità di preparazione dei campioni da analizzare
• Consulenza sull’analisi informatica dei dati
• Analisi dei dati
• La piattaforma offre anche la possibilità di usufruire solo di una parte del servizio: preparazione delle librerie; solo sequenziamento; utilizzo degli strumenti Illumina con personale di supporto.

Per informazioni, preventivi e prenotazioni di servizio si prega di contattare il Prof. Salvatore Oliviero, Responsabile della piattaforma, oppure la Dr.ssa Francesca Anselmi e la Dr.ssa Anna Krepelova, il personale incaricato con il quale si concorda anche la preparazione e la consegna dei campioni.

Le tariffe e le modalità di accesso all’infrastruttura sono consultabili su www.dbios.unito.it » Ricerca » Piattaforma NGS UniTo.

• Parametri di corsa flessibili, in termini di lunghezza delle sequenze, modalità di lettura dei frammenti (single o paired-end) e di quantità di sequenze ottenute
• Prestazioni del sistema: da 540Mbp a 15Gbp a seconda della chimica e dei parametri di corsa utilizzati

Attrezzatura acquisita anche con il contributo della Compagnia di San Paolo.

Applicazioni

• Sequenziamento di piccoli genomi
• Metagenomica 16S
• Sequenziamento RNA
• Sequenziamento HLA
• Sequenziamento forense
• Screening genetico
• Risequenziamento di geni di interesse

Servizi

• Consulenza nel disegno sperimentale
• Consulenza nelle analisi dei dati

L'accesso all'infrastruttura deve avvenire, previa prenotazione, con l'accompagnamento di personale autorizzato.
Le tariffe vengono definite in funzione delle richieste specifiche.
Le modalità di utilizzo e il supporto all’interpretazione dei risultati ottenuti è da concordare con i responsabili del Laboratorio.

Quanterix SR-X è l'ultimo strumento dotato della tecnologia Simoa® ed è in grado di offrire ai ricercatori la possibilità di rilevare biomarcatori a bassissime concentrazioni, con una sensibilità 100-1000 volte maggiore dell’ELISA. Alcune caratteristiche chiave includono:

• il rilevamento multiplex fino a sei analiti per pozzetto
• la misurazione delle concentrazioni di biomarcatori circolanti a livelli di femtogrammi/mL
• il volume richiesto per il dosaggio ridotto, anche per i tipi di campioni più preziosi
• la misurazione di biomarcatori sia di tipo proteico che di acidi nucleici.

Applicazioni

• Quantificazione di biomarker proteici e acidi nucleici

Servizi

• Consulenza nel disegno sperimentale
• Consulenza tecnica

È possibile accedere all'infrastruttura su prenotazione, accompagnati da personale autorizzato.

Le tariffe sono definite in funzione delle richieste specifiche.